此时徐州陷入一片混乱，徐州南部与袁术势力相接攘的有三个郡国，由西到东分别是彭城国、下邳国以及广陵郡。彭城国相薛礼和下邳国相笮融跑到了江东的秣陵依附刘繇，广陵太守赵昱又被笮融所杀，整个徐州南部陷入无政府状态，袁术便趁此良机出兵佔领了广陵郡南部与下邳国西南一带。

却说孙策，花了这麼大的功夫打下庐江，原本以為可以就此当上庐江太守，也占有一郡之地，没想到袁术却再度食言，指派了自己的手下刘勋接任。朱治见到袁术如此不讲信用，便劝孙策脱离袁术，靠自己的力量平定江东。孙策连续被袁术摆道两次，心底也颇不是滋味，反正父亲的旧部已经回到身边，便决定依照先前与张紘拟定的计画举兵东渡。

孙策对袁术说：”我家有旧恩在东，我自愿帮舅舅平讨横江，横江攻拔后可以募得叁万兵，到时候便可协助将军匡济汉室.”

袁术知道孙策对自己不满，但当时笮融、薛礼屯兵秣陵，刘繇盘据曲阿，与吴郡太守许贡、会稽太守王朗遥相呼应，丹阳、吴郡一带的深山又有山贼豪帅如祖郎、严白虎等，平定江东哪裡有那么容易，反正孙策也没向他多要兵马，袁术就封他为折冲校尉，姑且让他一试。

孙策带了一千多人从寿春出发，沿路招兵买马，到了吴景、孙贲屯驻的历阳，已经聚集了五、六千人。这时孙策的亲属已经被朱治平安送达，孙策见到家人们都安然无恙，心中踏实多了，便把母亲与年幼的弟妹们送到后方较為安全的阜陵，然后与众人商讨攻取横江津、当利口的计划。

周瑜知道叔叔周尚接任了丹阳太守，特别从老家前来探望，孙策听说周瑜也到了附近，赶紧写信请他前来相聚。周瑜得信，立刻从叔叔那裡调拨了一部份军马前来支援。孙策见到周瑜率兵前来，大喜说道：“有你在，大事可定！”而张紘听说孙策准备东渡。也从广陵前来历阳為他出谋划策。

孙策在周瑜、吕范、程普、黄盖、韩当、蒋钦、周泰、陈武以及吴景、孙贲、孙辅、徐琨等众将帅戮力齐心下，很快地便击败了驻守在横江津的樊能和于糜，接着便计划渡江袭取张英戍守的当利口，却苦於渡船数量不足。这时孙策的姑姑与表哥徐琨也在军中，孙策的姑姑对她的儿子徐琨说：“刘繇的部队军船眾多，要是我军渡江时他们水军大举进攻，对我军相当不利，不妨以现有舟船的两侧用芦苇搭盖浮板，以助军渡江。”徐琨把母亲的建议告诉表弟孙策，孙策便依计将部队输运过江。一举攻破张英，掌握了长江两岸的渡口。

孙策渡江后乘胜进击，所向皆破，莫敢当其锋，立刻攻下了丹阳的郡治宛陵。以及宛陵西南的牛渚营，取得了大量的粮秣与军备，声威大振。孙策在作战时常亲赴战场，张紘便劝諫他：“主将為全军指挥筹谋，是三军性命所系，实在不宜随便身临战场与敌寇相拼。您有天授之姿，又得四海之望。请不要让大家担心啊。”

孙策收定宛陵后，下一个目标就是东北的秣陵。这时薛礼驻军秣陵城，笮融屯驻在城南。笮融不知孙策的厉害，出屯打了一仗，结果被斩首五百余级，于是闭门不敢再战。孙策绕过笮融直接攻打秣陵城。没想到樊能、于糜等手下败将又收揽散卒想夺回牛渚营，孙策只好回军将他们击退，以防后方有失。

孙策稳定后方后，再度领兵攻打笮融，喜欢身临行阵的孙策这回学到了教训。被流矢一箭射中臀部，连马都不能骑了，只好暂时退回牛渚营。孙策派诈降兵士告诉笮融说自己已经中箭身亡，笮融信以為真，派部将于兹前往追击，却中了孙策的埋伏，被斩首千余人，笮融在惊恐之餘连忙加强壕沟堑垒等防御工事，再也不敢出战。孙策见笮融屯防之地地势险固，易守难攻，便先收定丹阳其他县邑去了。孙策一离开，笮融就先闹起内訌，把薛礼杀死，然后一口气跑到了扬州豫章郡的彭泽。

豫章郡在扬州西南隅，与荆州的江夏与长沙接攘，恰好这时豫章太守周术病死，袁术逮到染指的机会，立刻任命琅邪人诸葛玄為豫章太守。诸葛玄得到袁术的任命，便带着他十五岁的姪儿诸葛亮、诸葛均以及两个姪女南下就职，结果跟汉朝政府正式指派的朱皓闹了双胞，双方打了起来。因此，刘繇便派笮融前往豫章支援朱皓。这时着名的人物评论家，月旦评的主持人许劭也在曲阿避难，他劝刘繇说：“笮融这人出军从不顾名义，朱皓人太老实，你可要叫他小心提防笮融。”许劭一语中的，笮融到了豫章果然杀死朱皓自领太守。至於诸葛玄，在兵败后就带着诸葛亮等姪儿女们跑到荆州投奔刘表去了。

孙策收定了湖熟、江乘等丹阳东部诸县后，便举兵向吴郡曲阿来攻刘繇。这时与刘繇同乡的太史慈正好从辽东来访，旁边的人建议刘繇不妨以太史慈為大将，刘繇颇為犹豫，回说：“我若用太史慈，恐怕被许劭当笑话。”于是只派太史慈担任巡逻的任务。某一日，太史慈在神亭一带巡逻时，恰巧遇到孙策和黄盖、韩当、宋谦等十叁人也出外巡察敌情，太史慈一看到服装仪表非凡的孙策，便策马上前对战。

太史慈身高七尺七寸，相当於现在的177 公分，美鬚髯，猿臂擅射，功夫了得。然而孙策也不是省油的灯，他一鎗刺中太史慈的马，一手夺下太史慈颈后的手戟，太史慈也顺手摘了孙策的头盔，此时两方军马都杀到，酣斗中的两人才散开。

刘繇终究不是孙策的对手，兵败后往东南逃到丹徒，刘繇打算到会稽投奔王朗，许劭却不以為然，他说：「会稽殷富，是孙策所贪，而且又位处偏鄙的海隅。不可去也。不如前往豫章，北联豫州，西接荆州，在当地收合官民。遣使贡奉，可与曹操相连，虽然有袁术挡在中间，这人声名狼藉，必定不会得意太久。您是汉朝忠臣，刘表、曹操一定会对您伸出援手。」刘繇接受了许劭的建议，便一起逃往豫章去了。而太史慈则遁入丹阳南部的芜湖山区，凭他的武勇，当起了山大王。

孙策攻陷曲阿赶走刘繇后，赶紧派吴景与孙賁回寿春向袁术报捷。这时孙策的军众已达数万人。他认為以此兵力平定江东已经绰绰有餘，便派周瑜回宛陵协助他的叔叔周尚稳固丹阳局势，这时，孙策年仅20岁。孙策顺利攻取丹阳，又赶走了扬州刺史刘繇。进驻了吴郡的曲阿。许多地方官员们听说孙策到了，都捐城郭奔走，孙策不用花太大功夫就收取了诸县。孙策的部队军纪严整，对百姓丝毫不犯，甚得民心，百姓纷纷以牛酒诣军。孙策又出榜安民，只要有刘繇、笮融的部下前来投降。一律既往不咎，愿意从军的，只要一人

到部，全家终生免税；不愿从军的，绝不强迫。命令贴出不到十天，刘繇、笮融藏匿各地的旧部两万多人蜂拥而来。孙策的声势可谓震慑江东。